En toute logique, le métro est devenu le moyen de transport le plus utilisé. Si certaines parties du réseau sont inexploitables à cause d'éboulements, il est possible de rejoindre la majeure partie des quartiers via les lignes principales. Il n'y a qu'une seule station par quartiers, afin de limiter les arrêts et maximiser le rendement. Bien que de nombreuses personnes prennent le métro, celui-ci n'est pas si courant que ça, ne faisant bien souvent qu'un seul voyage par heure dans les deux sens. Cette diminution des transports s'explique par le besoin d'énergie demandée par ses grosses machines qui videraient les réserves en un mois si elle tournait comme à l'époque. Le réseau du métro possède actuellement quatre lignes principales :
- Ligne 1 : Manhattan - Queens
- Ligne 2 : Manhattan - Brooklyn
- Ligne 3 : Brooklyn - Queens
- Ligne 4 : Manhattan - Bronx
Une cinquième ligne, reliant le Bronx au Queens devait être inaugurée, mais les travaux ont été arrêtés suite à un attentat en 1976 qui a fait une vingtaine de mort. Bien que personne n'a jamais revendiqué la bombe on pense que les Yankees ne voulait pas d'un accès direct entre les Arkangels et le marché noir.